Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA3P35244 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms