Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms