Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms