Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
IL3RAP26951 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms