Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms