Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms