Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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