Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms