Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOP08100 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOP08100 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms