Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAPLNO95428 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAPLNO95428 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms