Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP104O60308 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms