Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COCHO43405 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms