Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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