Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms