Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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YIPF1Q9Y548 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YIPF1Q9Y548 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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