Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AFG3L2Q9Y4W6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AFG3L2Q9Y4W6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AFG3L2Q9Y4W6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms