Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLXND1Q9Y4D7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms