Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms