Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP164Q9UPV0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms