Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms