Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms