Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PEF1Q9UBV8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PEF1Q9UBV8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PEF1Q9UBV8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PEF1Q9UBV8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PEF1Q9UBV8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PEF1Q9UBV8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms