Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms