Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms