Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms