Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms