Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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