Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms