Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms