Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP3Q8WYN3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms