Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms