Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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