Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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