Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms