Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms