Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms