Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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