Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms