Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q499Y3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q499Y3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q499Y3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms