Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms