Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms