Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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