Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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