Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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