Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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