Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms