Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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PTPRKQ15262 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PTPRKQ15262 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PTPRKQ15262 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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