Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms