Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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CHD4Q14839 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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