Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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